Биомаркеры старения - что это? Топ-5 биомаркеров старения
Здесь начинает появляться список биомаркеров старения, а также список электронных сервисов, по которым можно будет протестировать ваш организм на предмет старения.
Биомаркеры старения — это измеряемые показатели жизнедеятельности, которые воспроизводимо изменяются, количественно и качественно, с возрастом организма. Они могут иметь место на различных уровнях организации живой системы: они могут быть системными, например изменения в иммунной системе, в системе крови, в нейропсихических функциях, в функции почек; могут быть на клеточном уровне, например так называемое клеточное старение, когда в норме делящиеся клетки отказываются делиться, переходят в состояние покоя и уже не возвращаются в деление; могут быть на молекулярном уровне, например поломки хромосом или так называемая генетическая нестабильность, когда с возрастом ДНК повреждается, эти повреждения в клетках накапливаются, и их можно детектировать и определять возраст тканей или конкретных клеток по этим показателям. Источник
Каждому человеку для долгой и здоровой жизни необходимо диагностировать свой организм на наличие негативных изменений. С помощью диагностики можно избежать или оттянуть наступление многих болезней, в том числе, ассоциированных со старением. То, каким образом можно продиагностировать свой организм, мы рассматриваем в главе: Контроль и диагностика организма. Для определения каждой болезни может существовать целый список биомаркеров. Некоторые биомаркеры могут быть ассоциированы с несколькими болезнями одновременно. У старения может быть множество причин, ведь только одних теорий старения насчитывается более трехсот. Старение подкрадывается с разных сторон, поэтому необходимо быть во-всеоружии и, проводя мониторинг, постоянно давать отпор. В первую очередь необходимо учесть список главных болезней человечества, а также узнать личную предрасположенность к тому или иному заболеванию.
Невозможно судить о состоянии здоровья лишь по одному показателю организма. Необходимо разработать комплексные подходы в определении биологичесского возраста человека, Нужно брать биомаркеры из разных систем органов, так как все органы стареют с разной скоростью.
Сейчас известно порядка шестисот различных показателей, которые могут служить биомаркерами старения именно человека.
ЧТО ТАКОЕ БИОМАРКЕРЫ СТАРЕНИЯ
Источник: Биомаркеры старения - А.Москалёв Также рекомендуем: Биомаркеры и будущее медицины
|
Биомаркеры старения можно разделить на несколько уровней и групп:
Системный уровень
Кеточный уровень
Молекулярный уровень
ПРИМЕРЫ БИОМАРКЕРОВ СТАРЕНИЯ:
длина теломер у лейкоцитов | клиренс креатинина | холестерин липопротеинов высокой плотности | общий холестерол | количество белых кровянных тельц | высокочувствительный С-реактивный белок | hs-CRP, Триглицериды | азот мочевины | Аполипопротеин B\ Аполипопротеин A1 | индекс массы тела | гликированный гемоглобин или гликогемоглобин | cреднее артериальное давление | жесткость сосудистой стенки | скорость возвращения частоты сердечных сокращений к норме после физической нагрузки | авто-флюресценция кожи | жизненная емкость легких | эпигенетические маркеры метилирования ДНК | уровень маркеров воспаления, N-гликанов в крови | 8-oxo-dG в сыворотке
Топ-5 биомаркеров старения, доказанных наукой:
1. ЭПИГЕНЕТИЧЕСКИЕ ЧАСЫ
2. ПРОБЛЕМЫ С КОЛЛАГЕНОМ
3. ДЛИНА ТЕЛОМЕР
4. АКТИВНОСТЬ СИГНАЛЬНЫХ ПУТЕЙ
5. СОСТОЯНИЕ ИММУНИТЕТА
Минимальный набор биомаркеров от нестарение.ру
В условиях дефицита бюджета перед обращением к врачу для направления в лабораторию полезно знать что нужно продиагностировать в первую очередь, выбирая маркеры старения. Если распределить все маркеры старения по убыванию важности (сверху вниз), то это будет выглядеть так (я выбираю маркеры сверху вниз по списку в зависимости от моих финансовых возможностей, так как анализы в лаборатории платные):
- Толщина комплекса интима-медиа общей сонной артерии — маркер старения сосудов и смертности от инсульта и инфаркта (как часто — 1 раз в 3 года, начиная с 21 года)
- Артериальное давление — маркер риска смертности от инсульта и от ИБС, а также маркер риска деменции (как часто — еженедельно)
- ИМТ и объём талии — маркер риска смертности от ССЗ и рака (как часто — постоянно)
- СКФ — маркер старения почек и смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в год, начиная с детского возраста). В возрасте до 70-80 лет анализ на креатинин в крови, а в возрасте после 70-80 лет ещё дополнительно анализ на альбумин в моче.
- Витамин Б12 — маркер смертности и старения мозга (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста )
- ЧСС — маркер риска общей смертности у пожилых людей и людей среднего возраста (в том числе от ССЗ) (как часто — постоянно, начиная с 40 лет)
- ЭКГ — маркер смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста)
- ИФР-1 (Соматомедин С) — маркер скорости старения, а также риска рака, деменции и сахарного диабета (как часто — 1 раз в год, начиная с 21 года)
- Витамин Д3 в крови — маркер старения и смертности от рака и ССЗ (как часто — 1 раз в год, начиная с детского возраста)
- Гликированный гемоглобин — маркер смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в год, начиная с 30 лет)
- Интерлейкин-6 — маркер риска рака толстой кишки и печени, а также внезапной смерти от заболеваний сердца (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста)
- С-реактивный белок — маркер риска рака лёгких, а также смерти от инсульта (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста)
- Фракционный холестерин — маркер смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в пол года, начиная с 21 года)
- АЛТ — маркер скорости старения печени и риска смертности (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста)
- Индекс инсулинорезистентности HOMA-IR — маркер риска смертности (как часто — 1 раз в год, начиная с детского возраста. Только если индекс массы тела не превышает 25, иначе нет смысла делать этот анализ)
- Мочевая кислота — маркер риска смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в пол года, начиная с 21 года)
- Ферритин — маркер риска раковых опухолей (как часто — 1 раз в пол года, начиная с 40 лет)
- Альбумин в крови — маркер скорости старения и риска смертности (как часто — 1 раз в пол года, начиная с 40 лет)
- Гомоцистеин — маркер смертности от ССЗ и старения мозга (как часто — вместе с анализом на витамин Б12)
- Анализ на Калий (K+) — маркер смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в пол года, начиная с детского возраста)
- Уровень гормонов щитовидной железы — маркер риска общей смертности и смертности от ССЗ (как часто — 1 раз в год, начиная с детского возраста)
- УЗИ брахиоцефальных артерий, аорты и артерий нижних конечностей — диагностика атеросклероза. Брахиоцефальные артерии — сосуды, которые участвуют в кровоснабжении головного мозга.
- Гастроскопия – диагностика рака желудка на ранней стадии (как часто — 1 раз в год, начиная с 40 лет)
- Малодозовая КТ грудной клетки – для диагностики рака лёгкого на ранней стадии (как часто — 1 раз в год — только тем, кто курит и людям, имеющим профессиональный контакт с асбестом, хромом, мышьяком или углем).
- Маммография (либо УЗИ молочных желёз) — диагностика рака молочной железы на ранней стадии (как часто — 1 раз в год, начиная с 50 лет и до 75 лет)
- Пап-тест — для определения предраковых или раковых клеток во влагалище и шейке матки (как часто — 1 раз в 3 года, начиная примерно с 21-25 лет, но более конкретно см. описание теста по ссылке)
- ПСА общий — маркер рака предстательной железы (как часто — 1 раз в год после 40 лет, если есть факторы риска: сидячий образ жизни, привычка употреблять жареную пишу, наследственность; после 60 лет — всем вне зависимости от факторов риска)
- Колоноскопия — диагностика рака толстой кишки, а также анализ кала на скрытую кровь (как часто — 1 раз в 3 года после 50 лет)
- Альфа-фетопротеин — маркер возможного рака печени (как часто — 1 раз в год — только при циррозе, гепатите и других болезнях печени)
- Мультиспиральная компьютерная томография (МСКТ) органов брюшной полости (обязательно с контрастированием!!!) — диагностика рака поджелудочной железы и печени (как часто — 1 раз в 3 года после 40 лет, но это очень дорогое обследование), либо эндосонография поджелудочной железы.
01.08.2017 Источник: Nestarenie.ru - Как определить биологический возраст
Биомаркеры старения - Норма Open Longevity
|
Михаил батин: "Таблица не полная. Да, она далеко не всеобъемлющая. Здесь нет гастроскопии и колоноскопии, УЗИ внутренних органов, характеристики состояния стволовых и сенесцентных клеток. Нет витамина D и интерликина 6. Потому что это все далеко улетает за 12 тысяч рублей, а мы хотели, вообще, меньше 10 тысяч. Нет здесь и профиля метилирования, так как не понятно, где сдавать такое. Микробиоты тоже пока нет. Но, думаю, скоро всё это появится, так как диагностика старения не будет стоять на месте." 26.07.2017 Источник: facebook.com/photo
Биомаркеры старения — это молекулярные процессы, сигнальные каскады, связанные с процессом старения клеток и организма в целом. Это показатели, отражающие степень риска умереть от возрастзависимых заболеваний. Зная отклонение этих показателей от нормы, их можно регулировать и в результате замедлять старение. Эти сигнальные маркеры обнаруживаются в результате доступных каждому лабораторных тестов. С помощью панелей биомаркеров Open Longevity можно определить состояние организма и подобрать подходящие геропротекторы. Сдать анализы на диагностику старения можно в сети лабораторий ДНКОМ http://dnkom.tilda.ws/ol
В панель диагностики старения Open Longevity входят следующие исследования (c нормой OL 1.1):
Аланинаминотрансфераза (АЛТ) — 14–31 ед/л для женщин; 17–41 ед/л для мужчин
Альбумин — 43–52 г/л
Витамин В12 (цианокобаламин) — 600–900 пг/мл
Глюкоза — 4,1–5,9 ммоль/л
Гомоцистеин — не выше 7 мкмоль/л
Инсулин — 2,7–10,4 мкЕд/мл
Калий (K+), Натрий (Na2+),
Хлор(Cl-) — K+ 3,5–4,5 ммоль/л
Креатинин (для расчета скорости клубочковой фильтрации)
Мочевая кислота — 150–280 мкмоль/л для женщин, 210–363 — для мужчин
ИФР-1 (Соматомедин С) — 105–130 нг/мл
С-реактивный белок (ультрачувствительный) — ≤ 0,5 мг/л
Т3 общий — 3,1–6,8 пмоль/л
Т4 общий — 66–181 нмоль/л (20 лет и старже)
Триглицериды ТТГ — 0,4–4 мкМЕ/мл (для взрослых)
Ферритин — 40–55 нг/мл для женщин, 40–80 — для мужчин
Холестерин общий — менее 5,18 ммоль/л
Холестерин-ЛПВП — 0,70–1,99 ммоль/л
Холестерин-ЛПНП — менее 1,8 ммоль/л
Гликированный гемоглобин (HbA1) — не выше 5,7%
Дуплексное сканирование сонных артерий с определением толщины комплекса интима-медиа — менее 0,7 мм
ЭКГ (с расшифровкой)
Aging.ai - определение возраста по анализу крови. 12-41 показатель
Существует электронный сервис, с помощью которого можно анализировать возрастные изменения по биомаркерам крови.
Вот ссылка на русскоязычный обзор данного сервиса (нашим сайтом): Aging.ai - Определяйте свой возраст по анализу крови с помощью нейронных сетей.
Здесь можно его обсудить и посмотреть результаты использования некоторыми участниками: Форум - биомаркеры старения
Список компонентов крови для анализа из сервиса Aging.ai:
Гамма-глобулины
Триглицериды
хлор
Холестерин HDL
LDL холестерина (по Фридевальд)
кальций
калий
натрий
Железо
гемоглобин
МЧ
МСНС
MCV
Тромбоциты
Лейкоциты
ALT
АСТ
Базофилы
Эозинофилы
Моноциты
Нейтрофилы
Зарубежный сайт, на котором можно найти все биомаркеры старения человека
Отличный сайт, на котором можно найти все биомаркеры старения человека: mortalitypredictors.org
Зарубежные клинические испытания с использованием биомаркеров старения
ЕЩЁ БИОМАРКЕРЫ СТАРЕНИЯ ПО КРОВИ:
(Эти биомаркеры используют в официальных клинических испытаниях терапии антистарения, основанной на переливании плазмы от молодых доноров)
Подробный русскоязычный обзор исследования читайте здесь: Четыре испытания лекарств от старости и биомаркеры старения
Ссылка на официальное исследование
Первичное измерение результатов:
- Кровь на биомаркеры (1/3) [Временные рамки: Переход от времени до лечения до 1 месяца после лечения]
WBC (уровень лейкоцитов в крови), RBC (содержание эритроцитов в крови), гемоглобин, гематокрит, MCV (средний объем эритроцитов), МСН (средняя масса гемоглобина в эритроцитах), МСНС (средняя концентрация гемоглобина в эритроцитах), RDW (ширина распространения эритроцитов), Количество тромбоцитов, MPV (средний объем тромбоцитов), Differential (определение лейкоцитарной формулы), Альбумин, Соотношение Альбумин/Глобулин (расчетное), Щелочная фосфатаза, АЛТ, АСТ, АМК / креатинин (расчетный), Кальций, Диоксид углерода, Хлорид, Креатинин с СКФ Оценочное, Глобулин (расчетный), Глюкоза, Калий, Натрий, Общий билирубин, Общий белок, Азот мочевины, Адипонектин, альфа-1-антитрипсин, альфа-2-макроглобулин, альфа-фетопротеин, Аполипопротеин А-1, Аполипопротеин A-II, Аполипопротеин CI, Аполипопротеина C-III
- Кровь на биомаркеры (2/3) [Временные рамки: Переход от времени до лечения до 1 месяца после лечения]
Аполипопротеин Н, Аполипопротеин (а), Бета-2-микроглобулин, Brain-нейротрофический фактор, С-реактивный белок, CD40 лигандом, Раковый Антиген 125, Раковый Антиген 19-9, Карциноэмбриональный Антиген, Комплемент С3, EN-RAGE, Eotaxin-1, Эпителиально-полученный активирующий нейтрофилы белок 78, Эритропоэтин, фактор VII, Ферритин, Фибриноген, Гранулоцитарный колониестимулирующий фактор, Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор, Гормон роста, Гаптоглобин, Хорионический Гонадотропин человека бета, Иммуноглобулин А, Иммуноглобулин Е, Иммуноглобулин М, Инсулин, Межклеточной адгезии 1, Гамма-интерферон, Интерлейкин-1 альфа, Интерлейкин-1 бета, Антагонист рецептора интерлейкина-1, Интерлейкин-10, Интерлейкин-12 Субъединиц р40, Интерлейкин-12 субъединиц р70, Интерлейкин-13, Интерлейкин-15, Интерлейкин-16, Интерлейкин-17, Интерлейкин-2, Интерлейкин-23, Интерлейкин-3
- Кровь на биомаркеры (3/3) [Временные рамки: Переход от времени до лечения до 1 месяца после лечения]
Интерлейкин-5, Иинтерлейкин-6, Интерлейкин-7, Интерлейкин-8, Лептин, Макрофагальный воспалительный белок-1 альфа, Macrophage Inflammatory Protein-1 beta (макрофаг воспалительный протеин-1 бета), Хемокин, получаемый из макрофагов, Матричная металлопротеиназа-2, Матричная металлопротеиназа-3, Матричная металлопротеиназа-9, Моноцит хемотаксический протеин 1, Миелопероксидаза, Миоглобин, Нейрон-специфичная энолаза, Ингибитор активатора плазминогена 1, Простато-специфического антиген, Свободный, Лёгочный хемокин, регулируемый активацией, Сывороточный амилоид P-компонент, Фактор стволовых клеток, Т-Лимфоцитарный-Специфический белок RANTES, Тромбоспондин-1, Тиреотропный гормон, Тироксин-связывающий глобулин, Тканевый ингибитор металлопротеиназ 1, Транстиретин, Фактор некроза опухоли альфа, Фактор некроза опухоли бета, Фактор некроза опухоли-рецептора 2, Васкулярная молекула клеточной адгезии 1, Эндотелиальный фактор роста, Витамин D-связывающий белок, Фактор фон Виллебранда.
БИОМАРКЕРЫ ДРУГОГО ТИПА
(Из исследования метформина на продление жизни. Проверяется способность метформина восстановить профиль экспрессии генов пожилых людей с нарушенной толерантностью к глюкозе)
Подробный русскоязычный обзор исследования читайте здесь: Четыре испытания лекарств от старости и биомаркеры старения
Ссылка на официальное исследование
ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ БИОМАРКЕРЫ:
Первичное измерение результатов:
- экспрессия генов. (изменения в экспрессии генов в мышечной и жировой ткани с РНК-секвенированием (РНК-Seq) [Временные рамки: 12 недель лечения]
Исследователи предполагают, что лечение метформином приведет к изменениям в транскриптоме, возвращая профиль экспрессии пожилых людей с IGT к более молодому уровню. Исследователи будут проверять это путем выявления изменений в экспрессии генов в мышечной и жировой ткани с РНК Секвенированием (РНК-Seq). Исследователи также изучат экспрессию специфических генов-мишеней (с помощью RT-PCR), митохондриальное количество и морфологию и содержание макрофагов жировой ткани и активацию.
Вторичное измерение результатов:
- Смешанная толерантность еды. Оценка чувствительности к инсулину и секреции инсулина (используя модификацию индекса Мацуда) [Временные рамки: 12 недель лечения]
Оценка чувствительности к инсулину и секреции инсулина. Чувствительность к инсулину будет оцениваться по сравнению с уровнем инсулина и глюкозы, полученных в соответствии со стандартным питанием, с использованием модификации индекса Мацуда, который широко используется для неинвазивной оценки чувствительности к инсулину и показывает хорошую корреляцию (R = 0,73) с результатами эугликемических гиперинсулинемических клэмп-исследований.
Из изучения новых свойств метформина для улучшения адаптационных свойств у пожилых людей, увеличения мышечной массы и силы
Подробнее смотрите здесь: Четыре испытания лекарств от старости и биомаркеры старения
Ссылка на официальное исследование
ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ БИОМАРКЕРЫ:
Первичное измерение результатов:
- Размер Мышц (биопсия мышц и КТ латеральной широкой мышцы бедра будет использоваться для количественного определения площади поперечного сечения мышечного волокна.) [Временные рамки: 14 недель]
Будет определяться способность метформина улучшать гипертрофической ответ на тренеровки. Мышечная биопсия латеральной широкой мышцы будет использоваться для количественного определения площади поперечного сечения мышечного волокна, а также компьютерная томография для количественного определения физиологических мышц.
- Мышечная сила [Временные рамки: 14 недель]
Будет определяться способность метформина улучшать выносливость при тренировках на сопротивление, мышечная сила и проводиться тестирование мощности мускулатуры ног.
Вторичное измерение результатов:
- Мышечные макрофаги [Временные рамки: 16 недель]
Количество и тип макрофагов следующих метформин и прогрессивное сопротивление подготовки будет рассмотрен от мышечных биопсий до и после тренировки.
- Воспалительная экспрессия генов мышц [Временные рамки: 16 недель]
Определение колчественной экспрессии цитокинов.
Другие итоговые измерения:
- Количественная чувствительность к инсулину [Временные рамки: 16 недель]
Инсулин в ответ на стандартный ГТТ будет измеряться и чувствительность к инсулину будет рассчитываться с использованием индекса Matsuda.
Влияние метформина на уровень хрупкости ослабленных пожилых людей
Подробнее смотрите здесь: Четыре испытания лекарств от старости и биомаркеры старения
Ссылка на официальное исследование
ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ БИОМАРКЕРЫ:
Первичное измерение результатов:
- Изменение от базовой линии ослабленного состояния в 16 недель [Временные рамки: Исходная ситуация и в 16 недель]
Измерения: Индекс слабости 40 пунктов
Вторичное измерение результатов:
- Изменение от базовой линии в связанное со здоровьем - качество жизни (КЖ) в 16 недель [Временные рамки: Исходная ситуация и в 16 недель]
Измерение: EQ-5D (с разрешения)
- Изменение от базовой линии силы хвата руки через 16 недель [Временные рамки: Исходная ситуация и в 16 недель]
Измерение: сжимание рукой динамометра (Jamar Ручной гидравлический динамометр Модель J00105)
- Изменение от базовой линии в скорости походки через 16 недель [Временные рамки: Исходная ситуация и в 16 недель]
Измерение: тест ходьбы на 15 футов
- Изменение от базовой линии в сыворотке крови уровней миостатина в 16 недель [Временные рамки: Исходная ситуация и в 16 недель]
Измерение: тест ELISA
Доп. информация - определение возраста по метаболому, транскриптому, протеому
Дополнительная информация (сбор данных для структурирования:
Скорость возвращения частоты сердечных сокращений к норме после физической нагрузки, жизненная емкость легких. (Результаты оценки скорости старения организма по таким простым показателям являются очень неточными и маловоспроизводимыми даже для одного и того же человека в разные промежутки времени).
Но с приходом более современных подходов:
- длина теломер уже позволила говорить с точностью плюс-минус десять лет о возрасте человека,
- уровень маркеров воспаления, N-гликанов в крови — плюс-минус восемь лет,
- Измерение активности генов - эпигенетические маркеры метилирования ДНК являются на сегодняшний день самыми точными — это три года. (С возрастом изменение рисунка, метилирования определенных последовательностей днк. Метильная метка на днк вынлючает активность тех или иных генов. (один из наиболее точных биомаркеров например измерение метилирования клеток крови дает точность определения возраста около 3 лет). Также хорошо показали себя в предсказывании хронологического возраста с ошибкой всего лишь в 2 года эпигенитические 353 маркера метилирования днк Steve Horvath
Количество здоровья и количество среднестатистических лет: По анализу крови (метаболому, транскриптому, протеому).
ТРАНСКРИПТОМ:
Изменение экспрессии генов человека (транскриптом) при старении можно посмотреть здесь
— Теперь если у нас есть данные транскриптома (100$ цена транскриптома крови) или метаболома крови есть два хороших алгоритма вывести биологический возраст. Натренировать сеть глубокого обучения — в этом исследовании из 60000 образцов данных типичной биохимии крови, выводиться биологический возраст и пол. 6 Лет средний разброс результатов получили. Ансамбль DNN вывел пять самых значимых показателей — альбумин, глюкоза, щелочная фосфатаза, мочевина и эритроциты. М. Батин.
В Европе реализовывался проект MARK-AGE, где анализировались показатели метаболизма человека, активность тех или иных генов — у нас с вами больше 20 тысяч белок-кодирующих генов. Оказалось, что у ткани специфичным образом с возрастом меняется активность сотен и в некоторых тканях даже тысяч генов, и это является рисунком, характерным для того или иного возраста. И изменения активности этих генов можно использовать для того, чтобы модифицировать скорость старения, то есть отслеживать, как мы возвращаем в норму старческие возмущения в активности генов, этот хаос, который наступает в уровне активности тех или иных генов. В этой связи очень интересны исследования долгожителей. Давно было известно, что люди, которые живут больше 90–100 лет, на 20–30 лет позже заболевают различными возрастозависимыми заболеваниями, а некоторые из них вообще не заболевают ни диабетом, ни остеопорозом, ни старческой деменцией. Оказалось, что изучение метаболитов их крови, уровня активности тех или иных генов, метильных меток в ДНК позволяет найти те отличия от среднестатистического человека, которые характеризуют этих людей-долгожителей. И это отдельный аспект проблемы биомаркеров старения, то есть мы тогда пытаемся привести показатели конкретного человека не к более молодому возрасту, а к состоянию, близкому, например, к состоянию, наблюдаемому у долгожителей, в надежде, что это позволит достичь здорового долголетия, то есть пытаемся привести его не в молодое состояние, а в состояние долгожителя, который живет больше 100 лет. А. Москалев.
Отрывок из статьи Терапии против старения:
Возраст хронологический отмечает сколько нам лет по паспорту, а возраст биологический определяет нашу молодость и здоровье. Человек живет в развитых странах до 80 лет, это уже очень долго, по сравнению среднем временем жизни 100 лет назад.
Мы не можем протестировать, каким образом подействовала терапия на человека при клинических испытаниях, продлила она ему жизнь или нет, если у нас нет панели хороших маркеров, например по анализу крови (метаболому или транскриптому), говорящих что сейчас человек здоров или прожил 37 среднестатистических лет. И насколько терапия снизила темп скорости старения (еще один показатель — rate of aging). Также хорошим показателем является отклик на терапию (Если у нас есть когорты и мы можем сравнивать с другими пациентами). Поэтому биомаркеры старения являются строго необходимым показателем, для оценки результатов геропротекторов.
— Устоявшиеся биомаркеры старения на сегодня такие: длина теломер у лейкоцитов, клиренс креатинина, холестерин липопротеинов высокой плотности, общий холестерол, количество белых кровянных тельц, высокочувствительный С-реактивный белок, hs-CRP, Триглицериды, азот мочевины, Аполипопротеин B\ Аполипопротеин A1, Индекс массы тела, Гликированный гемоглобин, или гликогемоглобин, Среднее артериальное давление
Также хорошо показали себя в предсказывании хронологического возраста с ошибкой всего лишь в 2 года эпигенитические 353 маркера метилирования днк Steve Horvath
Изменение экспресии генов человека (транскриптом) при старении можно посмотреть здесь
— Теперь если у нас есть данные транскриптома (100$ цена транскриптома крови) или метаболома крови есть два хороших алгоритма вывести биологический возраст. Натренировать сеть глубокого обучения — в этом исследовании из 60000 образцов данных типичной биохимии крови, выводиться биологический возраст и пол. 6 Лет средний разброс результатов получили. Ансамбль DNN вывел пять самых значимых показателей — альбумин, глюкоза, щелочная фосфатаза, мочевина и эритроциты.
Пойти брутфорсом и выбрать из 1000 анализов крови 20 самых похожих на наш анализ, после подсчитать средний возраст этих 20.
Источник: geektimes.ru
Ссылки об определении возраста по метилированию ДНК:
Ссылка1 Возраст человека можно определить по метилированию его ДНК: cbio.ru/page/43/id/5361/
Ссылка2 Фирма Cygenia на коммерческой основе определяет биовозраст и риски заболевания ССЗ и раком: www.cygenia.com/?q=en%2Fepigenetic-services%2Fbiological-age
Ссылка3 Точность определения биологич. возр. по мет. ДНК намного выше чем у других способов определения: en.wikipedia.org/wiki/Epigenetic_clock#Accuracy
Алекс Жаворонков о биомаркерах старения (отрывок интервью с Россией2045)
Мы занимаемся изучением молекулярных аспектов всех систем, органов и тканей.
Изучаем, как старение влияет на изменение транскрипционного профиля экспрессии генов с возрастом. Мы объединяем отдельные гены в сети, а потом смотрим изменение активации этих сетей в процессе старения. И смотрим какие препараты воздействуют на эти сети, чтобы вернуть в спять процессы старения и вернуть транскрипционные профили старых тканей к транскрипционным профилям более молодых тканей.
Таким образом мы разрабатываем геропротекторы.
Также занимаемся применением глубокого машинного обучения. Источник
ПРОТЕОМ:
Протеомные биомаркеры, то есть, например, уровень тех или иных ферментов в циркулирующей крови:
- Это могут быть маркеры, связанные с неферментативным взаимодействием между белками и сахарами, так называемый конечный продукт гликирования.
- Это могут быть маркеры повреждения ДНК, — например, 8-оксигуанин является маркером оксидативного, окислительного повреждения молекул ДНК, и его уровень с возрастом действительно увеличивается. Количество митохондрий в клетках с возрастом снижается (митохондрии — это энергетические станции клеток, отвечающие за синтез АТФ, который необходим для всех метаболических процессов как источник энергии). И наоборот, внеклеточная ДНК, в том числе митохондриальная ДНК, в крови все больше и больше скапливается с возрастом, и это приводит к воспалительным процессам, потому что митохондрии и их окисленная кольцевая ДНК напоминают бактериальную и организм реагирует как на инфекцию, хотя это процесс, вызывающий воспаление, но по внутренним причинам нашего организма.
Клеточный уровень: Клеточное деление.
Молекулярный уровень: Изучение поломки хромосом.
Схемы и дорожные карты изучения биомаркеров старения
Интегрированная система биомаркеров старения
Некоторые слайды Биотехнологии – ваш билет в будущее:
Планы
1. Необходимо описать классификацию биомаркеров старения, например:
- По анализу крови (метаболому, транскриптому, протеому).
- Биомаркеры старения каждого органа.
- Неврологические биомаркеры.
- Онкобиомаркеры.
- Другие...
2. Создать инструкции улучшения различных биомаркеров.
По всем вопросам интересные ссылки и переводы выкладывайте здесь: Форум - биомаркеры старения
НОВОСТИ ИЗУЧЕНИЯ БИОМАРКЕРОВ СТАРЕНИЯ